Звездният му час обаче идва след 1999 г., когато Масимо Д’Алема го предлага за една от най-важните позиции в ЕК на сънародника му Романо Проди - като отговарящ за конкуренцията. Като еврокомисар по конкуренцията Монти разследва редица корпоративни сливания, сред които това на “Скания” и “Волво” (1999 г.)