Проф. Николай Денков се завръща в Министерството на образованието и науката вече като министър, част от служебния кабинет на Огнян Герджиков. Той беше заместник-министър там от 2014 г. при последните трима ръководители на МОН - Румяна Коларова, Тодор Танев и Меглена Кунева, но напусна скоро след като Кунева пое поста, заради "съществените различия с приоритетите и стила на работа на министъра и част от екипа й".

Като зам.-министър на образованието проф. Денков отговаряше за висшето...