Пема Цецо е родена в Аруначал Прадеш, Индия. Завършва начално училище през 1994 г. с награда стипендия от правителството на Индия и продължава да учи икономика и социология в Пенджабския университет. Още в колежа у нея се зараждат импулси да служи на хората и интересите й се насочват към медицината.