ИА „Сертификационен одит на средствата от европейските земеделски фондове“ ще контролира средствата от Европейския фонд за морско дело и рибарство Контролът на средствата от Европейския фонд за морско дело и рибарство ще се осъществява от Изпълнителна агенция „Сертификационен одит на средствата от европейските земеделски фондове“.