Специализирани съоръжения за опазване на биоразнообразието като огради за птици и подлези за влечуги и земноводни са предвидени в защитените зони, през които ще преминава трасето на АМ "Струма". Това е записано в Доклада за оценка на съвместимостта, публикуван на интернет