Д-р Николай Шарков е председател на Управителния съвет на Български зъболекарски съюз, член е на Борда на директорите на Световната дентална федерация (FDI), основател и съветник на Балканското стоматологично общество (BaSS), почетен член на Македонската дентална камара. Д-р Шарков също така е преподавател в катедра „Детска дентална медицина“ във Факултета по дентална медицина при Медицински университет – София.